W połowie listopada 2023 r. specjalista w zakresie zdrowia publicznego i epidemiologii Roman Topór-Mądry został odwołany ze stanowiska prezesa agencji.
Kolejne konkursy nie przynosiły rozstrzygnięcia – aż do 27 marca.
Wtedy – w trzecim naborze – wybrano nowego prezesa. Został nim Daniel Rutkowski, dotychczasowy wiceprezes, a wcześniej zastępca dyrektora Departamentu Świadczeń Opieki Zdrowotnej Centrali Narodowego Funduszu Zdrowia.
Rutkowski to ekonomista, od początku kariery zawodowej związany jest z publicznym płatnikiem świadczeń opieki zdrowotnej.