Kierownik apteki na ryczałcie? Przełomowa interpretacja potwierdzająca stawkę 8,5%!

Farmaceuci prowadzący jednoosobową działalność gospodarczą często stają przed pytaniem: jaką formę opodatkowania wybrać? Czy ich praca to „wolny zawód” (stawka 17%), czy może działalność usługowa (stawka 8,5%), a może – ze względu na sporządzanie leków – działalność wytwórcza (5,5%)? Sytuację komplikuje fakt, iż kierownik apteki łączy funkcje administracyjne, menedżerskie i związane z udzielaniem usług farmaceutycznych.

Nowe światło na to zagadnienie rzuca najnowsza Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej z lutego 2026 roku (sygn. 0112-KDSL1-1.4011.788.2025.2.MJ). Jednoznacznie rozstrzyga ona wątpliwości dotyczące adekwatnej stawki podatku dla osób pełniących funkcję kierownika apteki. Interpretacja ta dotyczy przypadku magistra farmacji, który od stycznia 2026 roku świadczy usługi jako kierownik apteki na rzecz zewnętrznego podmiotu. Farmaceuta nie jest właścicielem apteki, ale zarządza nią na podstawie kontraktu B2B.

Zakres obowiązków a klasyfikacja PKWiU

Kluczem do ustalenia stawki podatku w ryczałcie jest zawsze adekwatne przypisanie usług do kodów Polskiej Klasyfikacji Wyrobów i Usług (PKWiU). W omawianej sprawie Wnioskodawca wskazał na dwa najważniejsze kody:

1. 47.00.74.0 – Sprzedaż detaliczna wyrobów farmaceutycznych (świadczona jako usługa na rzecz właściciela).

2. 82.11.10.0 – Usługi związane z administracyjną obsługą biura.

Jak czytamy w dokumencie, zakres obowiązków farmaceuty był niezwykle szeroki: „sprzedaż detaliczna wyrobów farmaceutycznych w imieniu właściciela apteki, zarządzanie magazynem, retaksacja recept, reprezentacja przed organami (NFZ, GIS), nadzór nad personelem oraz wykonywanie leków recepturowych”.

Dlaczego nie 3% lub 5,5%?

Farmaceuta w swoim zapytaniu do Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej słusznie wykluczył inne, potencjalnie niższe stawki. Potwierdził to zresztą organ podatkowy. Po pierwsze, mimo iż farmaceuta dokonuje sprzedaży leków, nie może on korzystać ze stawki 3%, która jest zarezerwowana dla działalności handlowej. Dlaczego? Ponieważ towary (leki) nie należą do niego.

– Wnioskodawca nie dokonuje sprzedaży towarów we własnym imieniu i na własny rachunek, ale świadczy usługę sprzedaży w imieniu podmiotu prowadzącego aptekę. Tym samym nie mamy do czynienia z handlem w rozumieniu ustawy o ryczałcie – zauważył KIS.

Po drugie, farmaceuta często sporządza leki recepturowe. Czy jest to działalność wytwórcza podlegająca stawce 5,5%? Organ uznał, iż nie.

– Wykonywanie leków recepturowych z surowców powierzonych przez aptekę, w ramach kompleksowej usługi zarządzania placówką, nie stanowi działalności wytwórczej, ale usługową. Praca ta jest elementem szerszego procesu opieki farmaceutycznej i obsługi pacjenta – czytamy w interpretacji.

Właściwa stawka to 8,5%

Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej, po przeanalizowaniu stanu faktycznego, przychylił się do stanowiska farmaceuty. W uzasadnieniu czytamy: „Przychody z działalności usługowej, sklasyfikowanej pod kodami PKWiU 47.00.74.0 i 82.11.10.0, podlegają opodatkowaniu stawką 8,5% zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 5 lit. a ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym od niektórych przychodów osiąganych przez osoby fizyczne.”

To najważniejsze stwierdzenie rozwiewa wątpliwości dotyczące tego, czy usługi kierownicze w aptece powinny być opodatkowane wyższą stawką (np. 15% dla usług zarządzania). Organ uznał, iż skoro usługi te mieszczą się w definicji działalności usługowej i nie są wymienione w katalogu usług opodatkowanych wyższymi stawkami, to 8,5% jest stawką bazową i prawidłową.

Czy „prowadzenie apteki” wyklucza ryczałt?

Istotnym elementem analizy było zbadanie, czy farmaceuta nie wpada w tzw. wyłączenia z ryczałtu. Polska ustawa o ryczałcie przewiduje, iż niektóre rodzaje działalności (np. prowadzenie aptek przez właścicieli) mogą być ograniczone w dostępie do tej formy opodatkowania.

W tym przypadku KIS dokonał ważnego rozróżnienia: pełnienie funkcji kierownika apteki to nie to samo co prowadzenie apteki w sensie prawnym (posiadanie zezwolenia).

– Pełnienie funkcji kierownika apteki przez farmaceutę w ramach kontraktu B2B nie jest tożsame z prowadzeniem apteki w rozumieniu przepisów o zezwoleniach, co oznacza, iż wnioskodawca może w pełni korzystać z ryczałtu ewidencjonowanego – czytamy w interpretacji.

Praktyczne implikacje dla farmaceutów

Interpretacja z 19 lutego 2026 r. to krok w stronę ucywilizowania rozliczeń farmaceutów na kontraktach B2B. Jasno wskazuje, iż osoba zarządzająca apteką, dbająca o jej personel, zapasy i sprzedaż, jest usługodawcą uprawnionym do korzystania z jednej z najkorzystniejszych stawek ryczałtu. Dokument ten jest niezwykle cenny dla całego środowiska farmaceutycznego z kilku powodów:

1. Bezpieczeństwo podatkowe: Daje solidną podstawę dla magistrów farmacji do stosowania stawki 8,5% zamiast 15% czy 17%.

2. Jasność w PKWiU: Potwierdza, iż kody 47.00.74.0 oraz 82.11.10.0 są adekwatne dla szerokiego spektrum zadań kierownika apteki.

3. Status leku recepturowego: Rozstrzyga, iż robienie leków na zlecenie (z materiałów apteki) to usługa, a nie produkcja.

To również istotny sygnał dla wielu kierowników aptek. Oznacza możliwość legalnego obniżenia obciążeń podatkowych, pod warunkiem rzetelnego udokumentowania zakresu czynności i dbania o to, by nie wystąpiły przesłanki do uznania ich pracy za stosunek pracy (tzw. test przedsiębiorcy).

Warto jednak pamiętać, iż każda interpretacja indywidualna chroni tylko tego podatnika, który o nią wystąpił. Niemniej jednak, argumentacja zawarta w niej stanowi silną linię orzeczniczą, na którą mogą powoływać się inni farmaceuci w sporach z organami skarbowymi lub przy konstruowaniu własnych wniosków o interpretację.

Źródło:

• Opracowano na podstawie interpretacji Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej z lutego 2026 roku (sygn. 0112-KDSL1-1.4011.788.2025.2.MJ)

©MGR.FARM

Niniejszy artykuł ma charakter informacyjny i nie stanowi porady prawnej ani podatkowej. Przed podjęciem decyzji o wyborze formy opodatkowania skonsultuj się z doradcą podatkowym.